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隨著厭氧菌培養技術的進步，已證實許多外科感染性病患與厭氧菌有關，厭氧菌大致分成兩大類，即革蘭氏陰性厭養菌和革蘭氏陽性厭氧菌。革蘭氏陰性厭氧桿菌包括脆弱類桿菌、狄氏類桿菌，多形類桿菌，棱形桿菌等。革蘭陽性厭氧菌包括破傷風桿菌，棱狀芽胞桿菌、消化球菌等。腹部、泌尿生殖系統、齒齦，顱內感染以及敗血癥，常與厭氧感染有關。如最常見的急性化膿性闌尾炎，厭氧菌感染占有相當大的比例；又如齒槽膿腫，也以厭氧菌感染為主。

顧名思義，厭氧菌能在缺氧的條件下繁殖。厭氧菌感染的特點是：

1、多發生在粘膜或其鄰近部位，如腹腔、盆腔，胸腔等。
2、多為慢性和來自身體內部（如消化道，中耳等處）的感染。但破傷風多由外界的破傷風桿菌引起。一旦人體抵抗力降低或條件適合時，這些感染可導致急性發作。
3、常與需氧菌等形成混合感染。
4、人體對厭氧菌無免疫性。

厭氧菌感染時局部形成的膿液或浸出液有腐敗臭味，可出現組織壞死、壞疽、氣體形成，假膜形成，化膿性血栓性靜脈炎或多發性膿腫等改變。如果治療不及時或者延誤治療，可以增加死亡率。

為及時診斷，常需作厭氧菌培養，這種技術并不復雜，但條件差的醫院還不能開展此項工作，因此對正確使用敏感抗生素會帶來一定的盲目性。醫生只能根據臨床經驗及小兒病情選用抗生素。

小兒外科在厭氧菌感染時常用的抗生素有：青霉素、甲硝唑，克林霉素，頭孢哌霉素、頭孢美唑，安美汀等。其中甲硝唑毒性低，副作用少，到達感染灶能力強，耐藥菌株少，價格便宜，所以目前是治療厭氧菌感染的首選藥物。以外，萬古霉素，桿菌肽主要用于"難辨棱狀芽胞桿菌"引起的偽膜性腸炎。

除抗生素療法外，增強身體抵抗力，矯正貧血和電解質紊亂及低蛋白血癥，盡快消除病灶，預防傷口及手術區感染等措施，對治療厭氧感染也非常重要。